中心实行主任负责制,主任由学校任命,全面负责中心的建设、发展和运行,校内接受教务处、资产与实验室管理处的管理和业务指导,校外通过校校联合、校企共建等方式满足实验资源需求。中心设副主任2人,由主任提名,学校任命,协助主任工作,主管实验教学研究与实验室建设,实验室仪器设备与实验室日常管理等工作。中心由结构实验室、建筑材料实验室、道桥实验室、流体力学实验室、CAD实验室、土工实验室、工程测量实验室、防火减灾实验室、施工与管理实验室等九个分室、土木工程国家级虚拟仿真实验教学中心以及中心办公室组成。中心的组织结构见下图。
土木工程实验教学示范中心组织结构图